秘密任務和隱藏點通常隱藏在場景的角落或特定交互點，需要玩家仔細觀察雷達提示和環境細節。隱藏點主要提供武器、彈藥和金錢獎勵，雖然部分武器屬性一般，但出售后可積累大量資金用于購買高級裝備。例如第一關控制室后方、第二關與將軍對話后右側箱子、第三關商店對面的寶箱均含有隱藏物資，建議每進入新場景時優先探索邊緣區域和可破壞物件。
部分隱藏任務與支線劇情緊密關聯，比如第三關門口士兵的支線任務，選擇立即完成可獲得晶體，延遲至下一關完成則獎勵價值5000元的手槍。第五關的隱藏機制較為特殊，當怪物數量顯示剩余143左右時，需前往1號停車點觸發怪物刷新，第六關建議開局購買夜視儀和照明燈交替使用，第9個隱藏點內側靠墻位置存在隱藏房間，內含三幅畫像但無實際物資。
后期關卡隱藏點結構更復雜，第十二關第四個隱藏點附近需沿墻右拐進入地下房間，可獲取6000元獎勵。最終關卡對抗貝殼將軍時，左側洞穴通往地圖外圍，沿途需破壞12個發生器以削弱BOSS戰難度，該路徑需依賴雷達導航避免迷路。自爆蟲無限刷新的電閘關卡，需快速擊爆油桶清場，隱藏點提供的彈藥補給直接影響戰術選擇；而噴霧怪成片出現的下水道區域，提前獲取的大綠能量武器能顯著降低戰斗壓力。
雷達是定位隱藏點的核心工具，其探測范圍會隨玩家移動動態變化，靠近隱藏區域時信號強度明顯提升。部分隱藏點如第四關商店對面、第九關雙霰彈槍BUG觸發點，需反復嘗試角度或利用武器特性才能發現。游戲后期隱藏內容往往與主線進程深度綁定，例如打掉全部發生器才能徹底關閉BOSS戰中的干擾裝置。
