機關拼圖是游戲內常見的解謎玩法，主要涉及藏經室的內省和悟證關卡。玩家需要通過移動方塊整理經書，按照特定順序排列才能完成挑戰。內省關卡分為若一日至若六日六個階段，每個階段的方塊移動邏輯不同，需觀察初始布局后規劃路徑。
悟證關卡同樣采用分階段設計，從若一日到若七日共七個難度層級。玩家需將散落的經書方塊通過滑動操作歸位，關鍵是對齊經書邊緣的紋路。若三日的拼圖需優先處理右上角方塊，若五日則需先固定左下角區域。每次移動前建議觀察整體布局，避免反復調整。
部分機關拼圖與主線劇情相關，如結夢支線中的尋蘿任務。花明村、瓦舍等場景的寶藏位置隱藏著拼圖線索，需結合地圖坐標尋找對應觸發點。喬府后院的石雕機關需按特定順序互動，城門處的茶字招牌后也藏有拼圖碎片。這些分散元素需通過探索整合才能解開完整機關。
釣魚小游戲與機關解謎存在聯動機制。釣獲的觀賞魚可能攜帶拼圖碎片，而魯工神魚的貨物裝載量影響材料獲取效率。建議優先完成魚類圖鑒收集，以便為后續機關解鎖儲備必要資源。仙女湖的水草裝飾擺放也會間接影響相鄰區域的機關觸發條件。
蒲公英小隊派遣是獲取機關材料的重要途徑。將所需物品分配給小隊后，他們會帶回建筑升級用的特殊材料。注意不同品質的景觀擺放會影響材料產出效率，甲等和乙等景觀提供的舒適度加成為最優選擇。重復景觀可通過升階系統提升屬性，避免空間浪費。部分機關存在時間限制或隱藏條件。如蘭舟粽香活動期間的妙語詩才關卡，需先完成前置的成語接龍挑戰才能解鎖。南有喬木任務中的琴譜拼圖，則要求先收集散落在集市和書院的碎片。
