水生植物之所以能長在水中，是因為它的細胞間隙具有特殊的通氣組織，保證植株在水下也能有氧氣。這類植物一般分為五類，其中挺水植物直立挺拔，浮葉植物具有發達的根狀莖，葉子浮在水面。
沉水植物則沉于水中，濕生植物則生長在水池或小溪邊上，根部泡在水中，漂浮植物可以隨水漂流。
紫卡都是增強型植物，不能通過通關去解鎖，需要到戴夫的商店去花硬幣購買：
紫卡一共有八個成員：
機槍射手——一次性發射四顆豌豆（需要種在雙發射手上）
雙生向日葵——產出雙倍的陽光（需要種在向日葵上）
憂郁菇——以自身為中心向四周噴射大量煙霧（需要種在大噴菇上，傷害相比之前大幅度提升）
香蒲——發射尖刺，可以全屏導航攻擊僵尸（是水生植物，只能種在水里而且需要睡蓮）
冰瓜——投出高傷害而且擁有減速效果的子彈（需要種在西瓜投手上）
在玩《植物大戰僵尸2》游戲時單純的不讓水里的僵尸出來或盲目闖關的思維不可取，在打游戲時對付河里或水中的僵尸主要有兩種辦法:
一是讓僵尸露頭。方法是在河里或水中放置南瓜或墻果迫使其露頭，然后用重火力將露的僵尸攻下。
二是利用好荷葉。在荷葉上面建造陸地上的防御植物，并把巨型馬鈴薯放在上面以抵擋最強勢的一波水中攻擊。這樣用陸地防御植物就可以對付水中僵尸啦
