支線古墓通常隱藏在主線路徑之外，需要玩家仔細觀察環境并使用求生本能來發現入口。進入古墓前建議準備好足夠的箭矢和醫療包，部分謎題需要特定工具如攀爬斧或繩索箭才能解決。例如審判凝視古墓需要通過滑車原理調整神像前的梯子，而先知之墓則涉及水位控制與平臺移動。遇到復雜機關時，建議先使用求生本能觀察環境中的可互動元素，標記出關鍵部件的位置。
挑戰任務也是支線古墓的重要組成部分，如靶心挑戰要求射中特定目標，而獵鳥游戲則需要捕捉一定數量的小雞。這些挑戰通常分布在古墓周邊區域，完成它們可以獲得額外經驗值。地熱山谷區域的支線古墓尤為復雜，包含多個需要按順序觸發的機關。在解決謎題時，注意環境中的視覺提示，如特殊標記的墻壁或可破壞的結構。部分古墓需要在不同時間段探索，某些機關僅在特定條件下激活。
探索支線古墓時，合理分配技能點很重要。生存技能中的資源搜尋可以增加材料獲取量，而狩獵技能則能提升移動效率。建議優先解鎖與探索相關的技能，如增加求生本能范圍的鷹眼。古墓中的收集品包括遺物、錢幣儲藏點和文獻，這些物品往往放置在需要解謎才能到達的區域。
女巫神廟是游戲中較為特殊的支線古墓，包含獨特的劇情和BOSS戰。這個古墓的謎題涉及光線折射和平臺時序跳躍，需要精確操作才能通過。其他如冰船古墓則考驗玩家在限定時間內完成系列動作的能力。每個古墓通關后都會獎勵獨特的裝備藍圖或技能點數，這些獎勵對后期游戲進程很有幫助。
